Universitas Widya Dharma Klaten saat ini mempunyai  tiga Fakultas, satu Program Vokasi, satu Program Pasca Sarjana (S2), empat belas Program Studi Sarjana (S1), tiga Program Studi Ahli Madya(D3) dan satu Program Profesi (PPG).

Fakultas Ekonomi dan Psikologi mengelola tiga Program Studi (S1) yaitu :

Fakultas Teknologi dan Komputer mengelola empat Program Studi Sarjana (S1) yaitu :

Program Vokasi mengelola tiga Program Studi Ahli Madya (D3) yaitu :