Struktur Badan Penyelenggara  Universitas Widya Dharma Klaten yakni Yayasan Pendidikan Indonesia (YPI) terdiri dari 5 struktur yaitu Pembina Yayasan Pendidikan Indonesia, Pengawas Yayasan Pendidikan Indonesia, Ketua Yayasan Pendidikan Indonesia, Sekretaris Yayasan Pendidikan Indonesia dan Bendahara Yayasan Pendidikan Indonesia. Pengurus Badan Penyelenggara Universitas Widya Dharma Klaten yakni Yayasan Pendidikan Indonesia (YPI) tahun 2023 yaitu: